复合土工膜的整体施工程序为:垫层验收→复合土工膜铺设→底部土工膜缝合→土工膜焊接→土工膜焊缝检查→上部土工膜缝合→土工膜验收→覆盖保护垫层材料→保护层材料验收→砂浆块石→砂浆块石验收。

复合土工膜铺设:为了便于施工，保证拼接质量，复合土工膜应尽可能宽，以减少坝坡现场的拼接量。施工前，应根据复合土工膜的宽度和长度，在专用场地进行切割，拼接成所需尺寸的块，人工运至工作面铺设。坝体迎水面自上而下铺设(复合土工膜长平行于坝轴线)，水平方向从坡脚向外端铺设；铺设时，人行板应放置在两层复合土工膜上，并注意适度放松。要求复合土工膜与垫层的结合面一致、光滑，避免人为对施工机械造成损坏。施工人员应穿平布鞋或软胶鞋进行铺设，严禁穿钉鞋，以防踩在土工膜上。复合土工膜的铺设应与保护层的铺设相协调，使压力随铺设而增加。库区防渗垫层区在渗水泉内铺设人行板，在正反向土工膜之间铺设垫板，使复合土工膜的焊接处于干法施工。焊接检验合格后，反向土工膜逆时针旋转180度，开始复合土工膜铺设、焊接和检验的重复施工。